无偏见的组学方法发现 HIV-1 体内宿主限制因素

马里兰州沃尔特·里德陆军研究所领导的研究证实了之前针对 HIV-1 的宿主限制因素的研究结果。在《科学转化医学》杂志上发表的一篇题​​为“单细胞转录组学识别体内 HIV-1 胸腺肽 α 限制”的论文中，作者详细介绍了组学如何在寻找治疗策略中揭示相关性。

使用单细胞转录组学来鉴定 14 名 HIV-1 感染患者细胞中的活性蛋白质。研究小组通过将患者基因表达与单个细胞内的病毒 RNA (vRNA) 数量相关联，缩小了称为宿主限制因子的潜在抗病毒蛋白列表。这些蛋白质是人体先天免疫系统的一部分，可以识别并干扰病毒复制周期的特定步骤，从而阻止感染。

研究小组还比较了血浆病毒载量最高的参与者的测序，结果发现 vRNA 转录与编码胸腺肽αα (ProTα) 的基因 PTMA 的表达呈负相关。

随后在初始研究之外的 28 名其他参与者中验证了这种关联。胸腺素α原的体外过度表达证实该细胞因子抑制HIV-1转录和感染性病毒的产生。

研究人员发现个体免疫细胞中的 HIV-1 RNA (vRNA) 与特定的临床测量结果相关。通过单细胞分析，研究人员鉴定了急性 HIV 感染 (AHI) 和抗逆转录病毒治疗 (ART) 阶段参与者的带有 vRNA 的细胞。